MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 34052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014002	TAAA	2	8	63213	63220	75 %	25 %	0 %	0 %	294494745
1002	NC_014002	CCAC	2	8	63236	63243	25 %	0 %	0 %	75 %	294494745
1003	NC_014002	AGG	2	6	63269	63274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494745
1004	NC_014002	AGCC	2	8	63410	63417	25 %	0 %	25 %	50 %	294494745
1005	NC_014002	TC	3	6	63440	63445	0 %	50 %	0 %	50 %	294494745
1006	NC_014002	TCC	2	6	63464	63469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494745
1007	NC_014002	AGGGAA	2	12	63515	63526	50 %	0 %	50 %	0 %	294494745
1008	NC_014002	GTA	2	6	63547	63552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494745
1009	NC_014002	ATG	2	6	63934	63939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494746
1010	NC_014002	GCA	2	6	63984	63989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494746
1011	NC_014002	TATTC	2	10	64029	64038	20 %	60 %	0 %	20 %	294494746
1012	NC_014002	CTT	2	6	64051	64056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494746
1013	NC_014002	TGA	2	6	64168	64173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494747
1014	NC_014002	AAC	2	6	64197	64202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494747
1015	NC_014002	ACAA	2	8	64227	64234	75 %	0 %	0 %	25 %	294494747
1016	NC_014002	ATTTT	2	10	64266	64275	20 %	80 %	0 %	0 %	294494747
1017	NC_014002	TAC	2	6	64311	64316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494747
1018	NC_014002	AT	3	6	64327	64332	50 %	50 %	0 %	0 %	294494747
1019	NC_014002	TGT	2	6	64333	64338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494747
1020	NC_014002	GTTC	2	8	64352	64359	0 %	50 %	25 %	25 %	294494747
1021	NC_014002	A	6	6	64597	64602	100 %	0 %	0 %	0 %	294494748
1022	NC_014002	AAG	2	6	64650	64655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494748
1023	NC_014002	AACA	2	8	64671	64678	75 %	0 %	0 %	25 %	294494748
1024	NC_014002	TCC	2	6	64725	64730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494748
1025	NC_014002	T	6	6	64785	64790	0 %	100 %	0 %	0 %	294494748
1026	NC_014002	CTT	2	6	64800	64805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494748
1027	NC_014002	GTTA	2	8	64809	64816	25 %	50 %	25 %	0 %	294494748
1028	NC_014002	TGC	2	6	64912	64917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494748
1029	NC_014002	CTT	2	6	64997	65002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494748
1030	NC_014002	GCA	2	6	65065	65070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494748
1031	NC_014002	CAT	2	6	65115	65120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494748
1032	NC_014002	GCA	2	6	65324	65329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494749
1033	NC_014002	AGA	2	6	65590	65595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494749
1034	NC_014002	TGG	2	6	65635	65640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494749
1035	NC_014002	ATT	2	6	65744	65749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494749
1036	NC_014002	TCA	2	6	66086	66091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494750
1037	NC_014002	AT	3	6	66097	66102	50 %	50 %	0 %	0 %	294494750
1038	NC_014002	CTT	2	6	66166	66171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494750
1039	NC_014002	AGG	2	6	66217	66222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494750
1040	NC_014002	TTG	2	6	66243	66248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494750
1041	NC_014002	TTC	2	6	66409	66414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494751
1042	NC_014002	TCT	2	6	66426	66431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494751
1043	NC_014002	CTTT	2	8	66440	66447	0 %	75 %	0 %	25 %	294494751
1044	NC_014002	TCA	2	6	66479	66484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494751
1045	NC_014002	AT	3	6	66846	66851	50 %	50 %	0 %	0 %	294494752
1046	NC_014002	T	6	6	66851	66856	0 %	100 %	0 %	0 %	294494752
1047	NC_014002	TGA	2	6	66890	66895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494752
1048	NC_014002	AAAAT	2	10	66961	66970	80 %	20 %	0 %	0 %	294494752
1049	NC_014002	AAG	2	6	67060	67065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494752
1050	NC_014002	GAA	2	6	67133	67138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494752
1051	NC_014002	GGAT	2	8	67245	67252	25 %	25 %	50 %	0 %	294494752
1052	NC_014002	TGG	2	6	67349	67354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494752
1053	NC_014002	TTGATA	2	12	67381	67392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294494752
1054	NC_014002	TGC	2	6	67498	67503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494752
1055	NC_014002	GGAAA	2	10	67518	67527	60 %	0 %	40 %	0 %	294494752
1056	NC_014002	TG	4	8	67823	67830	0 %	50 %	50 %	0 %	294494752
1057	NC_014002	TGC	2	6	67913	67918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494752
1058	NC_014002	AAG	2	6	67929	67934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494752
1059	NC_014002	ATTG	2	8	68156	68163	25 %	50 %	25 %	0 %	294494753
1060	NC_014002	TGCTG	2	10	68258	68267	0 %	40 %	40 %	20 %	294494753
1061	NC_014002	ATT	2	6	68294	68299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494753
1062	NC_014002	T	6	6	68301	68306	0 %	100 %	0 %	0 %	294494753
1063	NC_014002	TAT	2	6	68334	68339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494753
1064	NC_014002	ATG	2	6	68371	68376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494753
1065	NC_014002	CTTT	2	8	68425	68432	0 %	75 %	0 %	25 %	294494753
1066	NC_014002	AT	3	6	68463	68468	50 %	50 %	0 %	0 %	294494753
1067	NC_014002	ATC	2	6	68494	68499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494753
1068	NC_014002	CTA	3	9	68531	68539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494753
1069	NC_014002	GAC	2	6	68585	68590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494753
1070	NC_014002	TTC	2	6	68598	68603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494753
1071	NC_014002	TGA	2	6	68702	68707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494753
1072	NC_014002	CTT	2	6	68797	68802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494753
1073	NC_014002	GTG	2	6	68992	68997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494753
1074	NC_014002	AAG	2	6	69063	69068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494753
1075	NC_014002	AGC	2	6	69095	69100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494753
1076	NC_014002	ATGAGT	2	12	69106	69117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494753
1077	NC_014002	ATT	2	6	69121	69126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494753
1078	NC_014002	GTG	2	6	69137	69142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494753
1079	NC_014002	AGG	2	6	69391	69396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494754
1080	NC_014002	ATA	2	6	69749	69754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494755
1081	NC_014002	AT	3	6	69823	69828	50 %	50 %	0 %	0 %	294494755
1082	NC_014002	AAGG	2	8	69844	69851	50 %	0 %	50 %	0 %	294494755
1083	NC_014002	TCC	2	6	69875	69880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494755
1084	NC_014002	AG	3	6	69898	69903	50 %	0 %	50 %	0 %	294494755
1085	NC_014002	A	7	7	69939	69945	100 %	0 %	0 %	0 %	294494755
1086	NC_014002	CGA	2	6	69963	69968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494755
1087	NC_014002	ACC	3	9	70054	70062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494755
1088	NC_014002	GCT	2	6	70084	70089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494755
1089	NC_014002	CCTG	2	8	70101	70108	0 %	25 %	25 %	50 %	294494755
1090	NC_014002	AAG	2	6	70217	70222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494755
1091	NC_014002	GAA	2	6	70276	70281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494755
1092	NC_014002	ATC	2	6	70295	70300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494755
1093	NC_014002	GAA	2	6	70327	70332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494755
1094	NC_014002	GAT	2	6	70502	70507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494756
1095	NC_014002	CAG	2	6	70573	70578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494756
1096	NC_014002	ATA	2	6	70601	70606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494756
1097	NC_014002	GAT	2	6	70635	70640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494756
1098	NC_014002	TGA	2	6	70694	70699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494756
1099	NC_014002	TTCT	2	8	70739	70746	0 %	75 %	0 %	25 %	294494756
1100	NC_014002	TCA	2	6	70752	70757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494756
1101	NC_014002	TCC	2	6	70775	70780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494756
1102	NC_014002	TGCAGA	2	12	70796	70807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294494756
1103	NC_014002	ATC	2	6	70815	70820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494756
1104	NC_014002	TC	3	6	70819	70824	0 %	50 %	0 %	50 %	294494756
1105	NC_014002	ATG	2	6	70933	70938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494756
1106	NC_014002	TCC	2	6	70953	70958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494756
1107	NC_014002	ATA	2	6	70995	71000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494756
1108	NC_014002	CTT	2	6	71020	71025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494756
1109	NC_014002	CAT	2	6	71084	71089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494756
1110	NC_014002	CCG	2	6	71139	71144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494756
1111	NC_014002	ACT	2	6	71184	71189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494756
1112	NC_014002	ATG	2	6	71202	71207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494756
1113	NC_014002	TAT	2	6	71224	71229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494756
1114	NC_014002	ATG	2	6	71529	71534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494757
1115	NC_014002	GAT	2	6	71544	71549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494757
1116	NC_014002	T	7	7	71636	71642	0 %	100 %	0 %	0 %	294494757
1117	NC_014002	TAG	2	6	71680	71685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494757
1118	NC_014002	ATT	2	6	71705	71710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494757
1119	NC_014002	T	7	7	71709	71715	0 %	100 %	0 %	0 %	294494757
1120	NC_014002	ACA	2	6	71781	71786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494757
1121	NC_014002	TAT	2	6	71790	71795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494757
1122	NC_014002	T	6	6	71795	71800	0 %	100 %	0 %	0 %	294494757
1123	NC_014002	GAAT	2	8	71884	71891	50 %	25 %	25 %	0 %	294494757
1124	NC_014002	ATCT	2	8	71904	71911	25 %	50 %	0 %	25 %	294494757
1125	NC_014002	TAC	2	6	71921	71926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494757
1126	NC_014002	CGGT	2	8	72006	72013	0 %	25 %	50 %	25 %	294494757
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